锦鲤属于鲤科，其身体结构与普通鲤鱼大致相同，但经过长期选育后，其体表色彩和形态更具观赏性。锦鲤体型呈纺锤形：前部较宽厚，向尾部逐渐收细，这种结构不仅美观，也便于在水中灵活游动。全身覆盖着排列紧密的鳞片，不同品种的鳞片大小和颜色各异，共同构成了锦鲤绚丽多彩的外观。

锦鲤拥有两对胸鳍和腹鳍（成对的偶鳍），以及单一的背鳍、臀鳍和尾鳍，共五大类鱼鳍。胸鳍位于鳃盖下方，主要用于转向和低速精细移动；腹鳍位于体腹部，辅助控制升降和平衡；背鳍位于鱼体顶部，有助于稳定鱼体、防止侧翻；臀鳍则位于尾鳍前下方，协助保持直线游动；而尾鳍则为主要的推进器，提供游动动力。锦鲤的鳍薄而柔韧，往往是鱼体健康状况的风向标——水质不佳时，鳍部往往最先出现充血或损伤。

锦鲤头部无鳞，口鼻部位生有一对明显的须状突起，称为吻须或触须。这对触须实际上是感觉器官，内部分布有丰富的味蕾和触觉细胞，帮助锦鲤在浑浊的水中探寻食物并感知周围环境。

此外，锦鲤主要通过鳃呼吸，鳃盖下设有鳃腮以从水中获取溶解氧。当水中溶氧不足时，它们会变得烦躁甚至浮上水面“喘气”。与大多数鱼类一样，锦鲤为变温动物，其新陈代谢速率随水温变化。当水温降至10℃以下时，新陈代谢和免疫功能会显著减弱，进入近乎休眠的状态。

值得一提的是，锦鲤与金鱼一样，并不具备真正意义上的胃。食物进入口腔后不会经过明显的胃囊储存，而是直接进入长而弯曲的肠道进行消化。锦鲤的肠道约为体长的2～3倍，内壁褶皱众多、绒毛密布，有助于增加吸收面积，从而充分消化纤维植物等食物。由于缺乏胃酸预消化，锦鲤主要依赖肠道和胰腺分泌的碱性消化酶来分解食物中的营养成分。这也决定了锦鲤更适合采用少量多餐的进食方式，并要求饲料易于消化；同时，频繁的排泄也要求养殖环境具备良好的过滤系统以保持水质稳定。

总体来看，锦鲤的生理结构不仅保留了鲤鱼耐寒、杂食、生命力顽强的特性，还在人工选育的过程中展现出艳丽的色彩和优美的体型，这正是锦鲤作为观赏鱼的重要魅力所在。